Topfly dispone de una moderna flota de aeronaves para realizar los Cursos de formación de Pilotos. En la actualidad la flota de TOPFLY se compone de 45 aeronaves y 8 simuladores de vuelo. La edad media de las aeronaves es de 5,7 años lo que convierte a la flota de TOPFLY en una de las mas modernas de Europa.
Entre las nuevas incorporaciones de los últimos años, destacan los aviones italianos TECNAM con dos modelos: P2002 y P2006. De este último, TOPFLY dispone de 4 unidades fabricados en 2009 siendo la FTO de lanzamiento del producto que fue certificado por EASA en Junio del mismo año.
Otro de los puntos a destacar es la incorporación de las aeronaves con aviónica GARMIN 1000 tanto monomotores como multimotores que permite a los cadetes familiarizarse a las nuevas tecnologías de información en las aeronaves durante su formación.
En cuanto a helicópteros, las fases iniciales se realizan con helicópteros Robinson 22 mientras que las fases avanzadas e IFR se realizan en helicóptero biturbina AS355 Ecurieuil.
Los simuladores de vuelo de avión y helicóptero son certificados según